Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRP1Q07954 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms