Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARID5AQ03989 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms