Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms