Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX1P78337 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX1P78337 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms