Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HBBP68871 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms