Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP11P59045 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms