Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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