Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCLCP48506 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCLCP48506 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCLCP48506 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms