Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CDKN1BP46527 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms