Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2E1P29083 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms