Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1P21675 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1P21675 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms