Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGAM1P18669 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGAM1P18669 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGAM1P18669 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGAM1P18669 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGAM1P18669 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGAM1P18669 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGAM1P18669 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGAM1P18669 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PGAM1P18669 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGAM1P18669 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PGAM1P18669 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGAM1P18669 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PGAM1P18669 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PGAM1P18669 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PGAM1P18669 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PGAM1P18669 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGAM1P18669 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGAM1P18669 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGAM1P18669 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms