Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DESP17661 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DESP17661 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms