Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMGA1P17096 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGA1P17096 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms