Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAV1P15498 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAV1P15498 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms