Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms