Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM10L2BP0DMW5 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms