Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTMAP06454 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTMAP06454 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTMAP06454 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTMAP06454 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTMAP06454 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTMAP06454 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTMAP06454 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTMAP06454 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTMAP06454 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTMAP06454 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTMAP06454 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTMAP06454 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTMAP06454 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTMAP06454 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTMAP06454 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTMAP06454 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTMAP06454 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTMAP06454 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTMAP06454 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTMAP06454 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTMAP06454 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTMAP06454 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTMAP06454 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTMAP06454 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTMAP06454 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTMAP06454 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PTMAP06454 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms