Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC1O14908 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms