Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CFAP99D6REC4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms