Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVV-2B6SEH9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms