Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

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Length 3,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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