Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms