Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms