Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms