Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SLC12A4Q9UP95 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC12A4Q9UP95 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC12A4Q9UP95 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC12A4Q9UP95 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC12A4Q9UP95 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC12A4Q9UP95 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC12A4Q9UP95 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC12A4Q9UP95 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC12A4Q9UP95 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms