Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRPF3Q9ULD4 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms