Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 RGS6-201ENST00000343854 5342 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 DLG5-201ENST00000372391 7415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 MMAA-201ENST00000281317 7068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 SCO1-201ENST00000255390 9612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 SETD7-201ENST00000274031 7365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 CXorf38-203ENST00000378426 4895 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 CUL5-201ENST00000393094 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 KCNH1-201ENST00000271751 8172 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 BAHCC1-206ENST00000584436 10801 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LAMTOR3Q9UHA4 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms