Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1982.9 ms