Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms