Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SH3BP4Q9P0V3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SH3BP4Q9P0V3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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SH3BP4Q9P0V3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SH3BP4Q9P0V3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SH3BP4Q9P0V3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SH3BP4Q9P0V3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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