Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms