Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GKN1Q9NS71 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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