Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMPRSS4Q9NRS4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms