Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms