Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFDQ9GZP0 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFDQ9GZP0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFDQ9GZP0 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFDQ9GZP0 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFDQ9GZP0 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFDQ9GZP0 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFDQ9GZP0 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFDQ9GZP0 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFDQ9GZP0 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFDQ9GZP0 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFDQ9GZP0 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFDQ9GZP0 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFDQ9GZP0 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFDQ9GZP0 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDGFDQ9GZP0 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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