Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms