Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms