Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIFKQ9BYG3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms