Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY5

CAPS2, Calcyphosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPS2Q9BXY5 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPS2Q9BXY5 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms