Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms