Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIGD2AQ9BW72 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms