Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
UPK3BQ9BT76 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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