Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERPUD2Q9BSE4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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