Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

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Length 2,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOTCH4Q99466 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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NOTCH4Q99466 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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NOTCH4Q99466 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTCH4Q99466 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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