Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP3Q96P20 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms