Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC11Q96DB2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms