Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms