Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRG4Q92954 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms