Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCDD1LQ8NCL9 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCDD1LQ8NCL9 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms